1940年，毛泽东在他著名的著作《新民主主义论》中进一步明确提出:“二十年来，这个文化新军的锋芒所向，从思想到形式（文字等）无不起了极大的革命。其声势之浩大，威力之猛烈，简直是所向无敌的。其动员之广大，超过中国任何历史时代。而鲁迅，就是这个文化新军的最伟大和最英勇的旗手。鲁迅是中国文化革命的主将，他不但是伟大的文学家，而且是伟大的思想家和伟大的革命家。鲁迅的骨头是最硬的，他没有丝毫的奴颜和媚骨，这是殖民地半殖民地人民最可宝贵的性格。鲁迅是在文化战线上，代表全民族的大多数，向着敌人冲锋陷阵的最正确、最勇敢、最坚决、最忠实、最热忱的空前的民族英雄。鲁迅的方向，就是中华民族新文化的方向。”

据刘继兴考证，在毛泽东已公之于世的所有著作中，对一位中国现代作家，包括其他历史人物，一口气连用了9个“最”的措辞，并冠之以“文学家、思想家、革命家”3个头衔的现象，是绝无仅有的。

1942年5月毛泽东发表《在延安文艺座谈会上的讲话》，这份代表着毛泽东文艺思想正式形成，一直指导中国文艺界的经典文献，在革命特定时期起着统一文艺思想的作用。但其理论主旨跟鲁迅的思想精神是有明显差异的，作为鲁迅思想中的最精华部分----独立批判精神被弃之一边。《讲话》否定了文艺的独立性，要求文艺无条件服从于政治。《讲话》认为，文艺要以政治保持一致，是建立在为人民和为政治的一致性的基础上。

1957年，毛泽东发动了反右运动。在反右已风起云涌之际，是年7月7日晚，毛泽东忽然召集部分文艺工作者座谈。赵丹、黄宗英以及翻译家罗稷南（原名陈小航，曾任十九路军总指挥蔡延锴的秘书）等参加了。会上，罗稷南与毛泽东有一段关于鲁迅的对话:

毛问:“你现在怎么样啊？”

罗答:“现在……主席，我常常琢磨一个问题，要是鲁迅今天还活着，他会怎么样？”“鲁迅么———”毛泽东微微动了动身子，爽朗地答道:“要么被关在牢里继续写他的，要么一句话也不说。”

鲁迅之子周海婴在《鲁迅与我七十年》一书中首先予以披露，因而“鲁迅活着会怎样”曾议论一时，据说曾亲聆毛泽东与罗稷南对话的黄宗英也为此撰文佐证。1961年10月7日，毛泽东挥毫书录鲁迅于1934年5月30日为悼念“五卅惨案”九周年而作的《无题》诗一首赠与访华的日本朋友:“万家墨面没蒿莱，敢有歌吟动地哀。心事浩茫连广宇，于无声处听惊雷。”

鲁迅无论在文学成就与还是声名影响上，都是当时名副其实的文坛领袖。他在文学界特别是青年界的影响是巨大的，他带有革命倾向的思想对当时的青年有巨大的启蒙作用。他当时的论敌通常以“思想界的权威”的帽子加以讽刺，反面映显了他的影响力。可以说，恨他入骨的国民党之所以迟迟不敢对他下手，社会影响大是其中原因之一。这样一个声誉隆巨，有进步倾向的作家，以他为旗帜，无疑可以征服更多进步作家倾向于革命，可以争取更多的进步青年献身于革命。这是毛泽东不可能不考虑的。然而像鲁迅这样永远对“现状”不满的文人，注定不是会受到任何讲政治的政党欢迎的。这样就不难解释毛泽东为什么一方面给予鲁迅最高的评价，把鲁迅当做旗帜；一方面又在文艺政策上一定程度地否定鲁迅的精神了。

毛泽东对鲁迅的感情很复杂。据一些权威的毛泽东研究资料的介绍:“毛泽东最爱读的现代人的书就是鲁迅的书，一部《鲁迅全集》从延安带到北京，阅读数遍，他对鲁迅熟悉程度，并不亚于鲁迅专家。”毛泽东晚年公开提及鲁迅已不多见。只在“文革”后期，毛泽东曾作过“最高指示”:“读点鲁迅。”这可能是毛泽东公开评价鲁迅的尾声。