贝加尔湖的一个有趣的哺乳动物代表是淡水海豹或贝加尔湖海豹，他们是北方海豹的亲系。科学家认为贝加尔湖海豹在冰河时期从冰海出发，经过艾尼斯河和安加拉河来到了贝加尔湖。现在贝加尔湖海豹的数量是60000只。这种贝加尔湖海豹能活50多年，并且一只雌贝加尔湖海豹可以繁殖多达20只小海豹。在贝加尔湖里数量最多的鱼是贝湖鱼。这是一种很小，像玻璃一样透明的鱼，其脂肪占了自身一半的重量。众所周知，深海鱼有能够摆脱重大水压的特殊水泡。贝湖鱼却没有这样的水泡，但是它能生活在很深的地方。五十亿贝湖鱼物种的总生物量大约是160000吨，此重量是是所有其它鱼加起来的两倍重。有50多种鱼栖息于此湖里，包括珍贵的鲑鱼物种——奥木尔鱼、白鲑、茴鱼、细鳞鲑、哲罗鱼、鳗鱼、鲈鱼。鲮鱼栖息于浅滩处，白梭鱼和其它鲤鱼物种生活在沿海水库里。贝加尔湖的最大的鱼是鲟鱼，其体长1.8米，体重为130公斤。最小的鱼是古尔维奇大头鱼，其体重是2毫克。生活在高海拔的哺乳动物有北山羊、雪豹、高海拔田鼠、高山鼠野兔、旱獭和森林旅鼠。在岩石和半岩石区，你可以碰到大蹄类动物：驯鹿、驼鹿、麝香鹿、西伯利亚狍、野猪。在食肉兽中有貂、高山黄鼠狼、真正的水獭和麝香鼠。在针叶林里，除了熊外，食肉兽还有猞猁、狼獾和狼。在毛皮动物有黑貂、松鼠、西伯利亚黄鼠狼、狐狸、山兔、花栗鼠、老鼠等。在森林草原里有獐、白鼬、地鼠、食虫生物和狼。