动荡平息后，当时的帝国皇帝下令重建圣智大教堂，但是百年之后的公元532年，第二个教堂再次毁于大火。但是有些大理石部分幸存下来，包括代表耶稣12门徒的12只羔羊雕塑。今日索菲亚大教堂正门入口处，人们可以看到从第二个圣智大教堂遗留下来的雕塑残存物。